Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHATP28329 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHATP28329 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHATP28329 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms