Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP1P23763 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms