Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRHP20396 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRHP20396 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRHP20396 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRHP20396 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRHP20396 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRHP20396 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms