Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms