Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms