Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE8BO95263 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms