Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OFD1O75665 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OFD1O75665 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OFD1O75665 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
OFD1O75665 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OFD1O75665 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OFD1O75665 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OFD1O75665 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OFD1O75665 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OFD1O75665 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OFD1O75665 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms