Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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VEGFDO43915 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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VEGFDO43915 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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VEGFDO43915 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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VEGFDO43915 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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