Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALUO43852 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALUO43852 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALUO43852 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALUO43852 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALUO43852 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALUO43852 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms