Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEFVO15553 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms