Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms