Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms