Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms