Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAXBP1Q9Y5B6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAXBP1Q9Y5B6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAXBP1Q9Y5B6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAXBP1Q9Y5B6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms