Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms