Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms