Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAI1Q9UI46 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms