Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms