Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRCC1Q9C099 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms