Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms