Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms