Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3CQ99985 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms