Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms