Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX18Q96RF0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms