Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms