Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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