Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDSS1Q5T2R2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms