Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms