Protein–RNA interactions for Protein: Q53HV7

SMUG1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMUG1Q53HV7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMUG1Q53HV7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMUG1Q53HV7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms