Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms