Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIN1Q05586 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms