Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms