Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms