Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms