Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms