Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms