Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FDFT1P37268 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms