Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD34P28906 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD34P28906 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms