Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GADD45AP24522 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms