Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms