Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms