Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBP08949 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBP08949 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBP08949 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBP08949 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBP08949 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NMBP08949 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NMBP08949 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms