Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCA5O60264 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms