Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CRXO43186 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CRXO43186 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CRXO43186 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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