Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BCKDKO14874 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms