Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKP3Q9Y446 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP3Q9Y446 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms