Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms