Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJB11Q9UBS4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms