Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMTM6Q9NX76 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms