Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms